alex1covo писал(а):Было бы очень круто, иметь такую базу для иммунома, но наверное это не при нашей жизни. Как я понимаю секвенированием иммунома интересуются сейчас только в РФ.
Базы для накопления данных об иммуноме уже создаются (в выступлении Сергея Анатольевича, на которое давалась ссылка в начале темы, такая база данных кажется упоминалась). Но там, насколько я понимаю, все еще на очень ранних стадиях и такие базы данных предназначены для исследователей, а не для рядовых потребителей.
Секвенированием иммунома не только в России занимаются - раньше в теме о трансплантации (и в вышеупомянутом выступлении Сергея Лукьянова) упоминалась
другая работа на эту тему, а на днях я
еще одну такую видел (правда у Сергея Анатольевича, как я понял, первое впечатление насчет заявленных в ней результатов было скептическим). Это только по ББ и если не искать специально (на последнюю из упомянутых работ я именно случайно наткнулся - сейчас попробовал целенаправленно, хотя и не сильно тщательно, поискать и кажется нашел
еще одну, но похоже не сильно интересную по результатам). Насчет анализа иммунома для других заболеваний также есть работы - некоторые из них упомянуты в списке литературы второй из упомянутых мной публикаций.
И кое-какие детали насчет анализа иммунома (возможно для данной темы лишние и несколько нагоняющие депрессиию - так что впечатлительных прошу дальше не читать
). Сначала поясню, что Т-лимфоциты образуются в тимусе путем случайной тасовки фрагмента генетического кода, кодируюшего Т-клеточный рецептор (то есть то, против каких "мишеней" этот лимфоцит и его потомки будут эффективны).
Чтобы были понятны сложности, связанные с анализом иммунома, напомню цифры из выступления Сергея Лукьянова - всего имеется 10 в 16 степени (десять тысяч триллионов!) теоретически возможных вариантов T-клеточного рецептора (ТКР). Надо полагать из них не все могут реализоваться (тимус отфильтровывает часть вариантов как негодные), но даже с поправкой на это у отдельного человека реализуется лишь очень небольшая часть из возможного разнообразия - что-то типа 100 миллионов вариантов ТКР. Первая из цифр больше второй в 100 миллионов раз - а это означает, что если ухитриться полностью (что не очень реалистично) описать разнообразие ТКР у двух разных людей, то скорее всего лишь один ТКР у них окажется одинаковым, а все остальные из 100 миллионов будут различаться. В реальности, как я понял, все оказывается несколько лучше - вероятно за счет ограничений накладываемых тимусом на разнообразие ТКР (и, может быть, того, что ТКР генерируются не полностью случайным образом), а также за счет некоторых технических ухищрений, позволяющих предполагать высокую степень сходства между некоторыми не полностью совпадающими ТКР. Но улучшения эти не слишком сильные и, например, даже у однояйцевых близнецов процент совпадений ТКР оказывается очень небольшим. И разнообразие ТКР надо еще и считать - пусть и сравнительно короткий участок ДНК, кодирующий ТКР, но сотни миллионов раз (реально похоже считывают меньшее количество, но это дает не полный иммуном, а только наиболее частые варианты ТРК). И на выходе будут последовательности ДНК, кодирующие ТРК, и для большей части этих последовательностей скорее всего нет никаких данных о том, что на какую мишень соответствующий ТКР нацелен.
Но при изучении B27-позитивного ББ через эти трудности кажется удалось как-то "прорубиться", возможно и для других заболеваний это тоже удастся со временем. Какие-то дополнительные подробности на тему исследований иммунома можно попробовать понять по ссылкам из
вот этого сообщения.
Но я надеюсь что это важно проводить на стадии исследования, а применение препарата, после отработки всех протоколов и подбора эффективной концентрации, анализов постоянных требовать не будет.